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10x Genomics平臺
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單細(xì)胞ATAC測序
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  • 產(chǎn)品描述

    單細(xì)胞ATAC測序(scATAC-seq)是基于10x genomics平臺的微流控和油滴包裹技術(shù),在單細(xì)胞水平對細(xì)胞染色質(zhì)開放區(qū)域進(jìn)行檢測的新技術(shù),可用于繪制細(xì)胞染色質(zhì)開放區(qū)的單細(xì)胞圖譜,是一種高分辨率研究染色質(zhì)開放程度與DNA結(jié)合蛋白調(diào)控基因的表達(dá)網(wǎng)絡(luò),在單細(xì)胞水平研究表觀遺傳學(xué)的有效手段。
    染色質(zhì)可及性的早期研究技術(shù)是ATAC-seq(Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing),該技術(shù)可進(jìn)行高通量測序的染色質(zhì)可及性(開放性)研究。10x Genomics 推出的 Chromium 單細(xì)胞 ATAC 解決方案提供了一種全面的、可擴展的方法來研究分析單個樣本中成百上千個細(xì)胞中染色質(zhì)的開放情況??稍趩渭?xì)胞水平進(jìn)行多組學(xué)聯(lián)合分析,深度挖掘細(xì)胞異質(zhì)性表觀遺傳調(diào)控機理。

    產(chǎn)品優(yōu)勢

    高通量的細(xì)胞捕獲,適用于細(xì)胞系、原代細(xì)胞、新鮮組織和凍存樣本的研究;
    單細(xì)胞水平揭示細(xì)胞核內(nèi)染色質(zhì)可接近性的差異;
    鑒定細(xì)胞類型特異的轉(zhuǎn)錄因子,深入研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò);
    技術(shù)重復(fù)性強、成功率高;

    實驗流程


  • 樣本類型建議送樣量存儲介質(zhì)保存、運輸條件
    凍存細(xì)胞>20 w1.將細(xì)胞重懸與凍存液(50% FBS+40%完全培養(yǎng)基+10% DMSO)中,每個凍存管加入≥20萬細(xì)胞
    2.將凍存管(標(biāo)記樣本名)放入程序降溫盒中,放入-80度冰箱,降溫6-24H后即可準(zhǔn)備運輸
    -80℃冰箱保存,干冰運輸
    新鮮細(xì)胞>10 w10%FBS常用培養(yǎng)基運輸時使用碎冰4°運送,新鮮細(xì)胞懸液盡可能在4h內(nèi)送達(dá)
    動物組織>30 mg/液氮速凍30min 后放于-80℃保存;干冰運輸
    植物葉片≥0.5g;莖≥1 g;根≥1 g/液氮速凍樣本,然后用預(yù)冷的錫箔紙包裹儲存在-80°C,干冰運輸
  • 研究方向/思路

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