單細(xì)胞ATAC測(cè)序簡(jiǎn)介

染色質(zhì)轉(zhuǎn)座酶可及性測(cè)序（ATAC-Seq）是確定全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)可及性的常  用方法。 ATAC-Seq可以對(duì)開放的染色質(zhì)區(qū)  域進(jìn)行測(cè)序，并以此來(lái)了解染色質(zhì)包裝和其他因素如何影響基因的表達(dá)。

實(shí)驗(yàn)原理

進(jìn)行ATAC-Seq時(shí)，基因組DNA會(huì)暴露在高  活性轉(zhuǎn)座酶Tn5中。 Tn5會(huì)優(yōu)先插入到開放染 色質(zhì)位點(diǎn)，使DNA片段化，并同時(shí)添加測(cè)序 引物（該過(guò)程名為轉(zhuǎn)座酶片段化）。測(cè)序的  DNA即代表開放的染色質(zhì)，可通過(guò)數(shù)據(jù)分析 深入了解基因調(diào)控。此外，  ATAC-Seq還可   以與RNA測(cè)序等其他方法相結(jié)合，作為多組  學(xué)方法來(lái)研究基因的表達(dá)

實(shí)驗(yàn)流程

數(shù)據(jù)性能

1.敏感性和特異性高

2.重現(xiàn)性高