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基因芯片
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Illumina CGA SNP基因芯片檢測
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  • 產(chǎn)品描述

    Illumina Chinese Genotyping Array(CGA芯片) 是一款先進(jìn)的基因分型芯片,由Illumina聯(lián)合微基因(WeGene)等機構(gòu)組成的聯(lián)盟共同設(shè)計,整合中國人群特異性遺傳變異數(shù)據(jù),可為群體規(guī)模遺傳研究、變異篩選和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究提供高價值、可擴展且經(jīng)濟高效的解決方案。


    產(chǎn)品優(yōu)

      1.  針對中國人群優(yōu)化,移除非相關(guān)位點,新增特有變異

      2.  廣泛的藥物基因組學(xué)標(biāo)記和外顯子內(nèi)容

      3.  廣泛的疾病種類覆蓋

      4.  高變異檢出率(>99%)和重現(xiàn)性(>99.9%)

      5.  可應(yīng)用于疾病風(fēng)險分析、藥物基因組學(xué)研究、健康和生活方式報告以及復(fù)雜疾病等研究

      6.  適用于各種樣本類型:唾液、血液、口腔拭子和FFPE樣本等

    核心技術(shù)特點

    1. 中國人群深度優(yōu)化

    • 位點覆蓋:移除非中國人群冗余位點,新增>70,000個中國人群特有變異位點(未見于公共數(shù)據(jù)庫),顯著提升低頻變異(MAF=1-5%)的檢測能力。

    • 插補精度:基于數(shù)萬例中國樣本的全基因組數(shù)據(jù)優(yōu)化,提高罕見變異插補準(zhǔn)確性,支持大規(guī)模疾病關(guān)聯(lián)研究。

    • HLA區(qū)域增強:整合10,000例漢族HLA樣本數(shù)據(jù),對>11,000個MHC標(biāo)簽SNP實現(xiàn)>80%的4位/2位HLA等位基因插補精度,助力免疫疾病研究。

    2. 全基因組與臨床位點整合

    • 全基因組骨架:覆蓋常見與低頻變異,提升全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)的統(tǒng)計效力。

    • 臨床功能性位點:納入多基因風(fēng)險評分(PRS)、藥物基因組學(xué)(如PharmGKB數(shù)據(jù)庫)、癌癥驅(qū)動突變等臨床研究熱點位點。

    3. 質(zhì)量控制與樣本管理

    • 內(nèi)置QC標(biāo)記:支持樣本追蹤、血統(tǒng)分析和分層研究,確保大規(guī)模隊列研究的可靠性



    實驗流程



  • 樣本類型建議送樣量保存、運輸介質(zhì)
    組織>50mg-80℃保存,干冰運輸
    細(xì)胞2 x 10^6-80保存,干冰運輸
    血液>1ml-80保存,干冰/4度(新鮮)運輸
    FFPEA.切片組織面積大于1cm2,切片表面無劃痕,無干裂,均勻貼片的石蠟切片;
    B.切片組織細(xì)胞>30000個;有核細(xì)胞比例>80%;腫瘤細(xì)胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細(xì)胞核占比未達(dá)80%以上,需提供5-12片;
    C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上;
    D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷
    4或常溫保存和運輸
    唾液>1ml,盡量收集較多的細(xì)胞常溫或4運輸
    口腔拭子1.5ml管 2管,或5ml管1管常溫或4運輸
    gDNA>1ug-80保存,干冰運輸


  • 研究方向/思路


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