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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
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Small RNA測(cè)序
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結(jié)果展示
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文獻(xiàn)案例
  • 產(chǎn)品描述

    小RNA(Small RNA)是一類長(zhǎng)度在18-30nt的內(nèi)源性RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等,是生命活動(dòng)重要的調(diào)控因子,在基因表達(dá)調(diào)控、生物個(gè)體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等生理過(guò)程中起著重要的作用。Small RNA測(cè)序(Small RNA-seq)是利用第二代高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)特定狀態(tài)下細(xì)胞或者組織中的全部Small RNA進(jìn)行深度測(cè)序,實(shí)現(xiàn)Small RNA序列的鑒定、靶基因分析和功能注釋等多項(xiàng)分析。

    產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
    1、通量高、敏感性高的技術(shù),對(duì)于多基因分析及低頻突變檢測(cè)具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)
    2、全基因組分析,無(wú)需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針能夠檢測(cè)未知基因

    3、低成本,高準(zhǔn)確性,大幅降低了測(cè)序時(shí)間
    4、數(shù)字化信號(hào),直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列,單核苷酸分辨率的精確度
    5、高深度的測(cè)序數(shù)據(jù),檢測(cè)新的miRNA

    實(shí)驗(yàn)流程

  • 數(shù)據(jù)分析

  • 樣本類型建議送樣量存儲(chǔ)介質(zhì)保存、運(yùn)輸條件
    組織>50mg1.RNA later;
    2.存入凍存管;
    3.大塊組織樣本不建議放入trizol保存;
    4.1.5ml無(wú)菌離心管
    -80℃保存,干冰運(yùn)輸
    細(xì)胞>2 x 10^61.收集的細(xì)胞沉淀,加入1ml trizol震蕩混勻-80度保存;
    2.收集的細(xì)胞沉淀,液氮速凍5-10min,-80℃冰箱保存;
    -80℃保存,干冰運(yùn)輸
    全血>1mlA.采用EDTA抗凝管采血,禁用肝素抗凝管,新鮮血液效果更佳。
    B.或者分離出PBMC加 trizol 混勻。
    C.或者全血離心去掉血漿加 trizol 混勻。
    D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube靜脈真空采血管(全血RNA管)
    PS:請(qǐng)盡量不使用RNA later保存全血。
    -80℃保存,干冰/4度(新鮮)運(yùn)輸
    FFPEA.切片組織面積大于1cm2,切片表面無(wú)劃痕,無(wú)干裂,均勻貼片的石蠟切片;
    B.切片組織細(xì)胞>30000個(gè);有核細(xì)胞比例>80%;腫瘤細(xì)胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細(xì)胞核占比未達(dá)80%以上,需提供5-12片;

    C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上;
    D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷
    /4℃或常溫保存和運(yùn)輸
    RNA>1ugDEPC水;Water Nuclease-Free-80℃保存,干冰運(yùn)輸
  • 研究方向/思路

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